兔冠狀病毒HKU14
兔冠狀病毒HKU14(Rabbit Coronavirus HKU14、RbCoV HKU14)是乙型冠狀病毒屬的一種病毒,在中國廣州市場中的家兔體內被發現,於2012年由香港大學的研究人員發表[1]。
兔冠狀病毒HKU14 | |
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病毒分類 | |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
种: | 兔冠狀病毒HKU14 Rabbit Coronavirus HKU14
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分類
兔冠狀病毒HKU14與乙型冠狀病毒1型、鼠冠狀病毒、人類冠狀病毒HKU1與中國鼠冠狀病毒HKU24皆是乙型冠狀病毒屬支序A(lineage A)的病毒,此演化支的病毒基因組中皆編碼血细胞凝集素酯酶(HE),其他冠狀病毒則無[2][3]。支序A中兔冠狀病毒HKU14與乙型冠狀病毒1型的關係接近(較中國鼠冠狀病毒HKU24與乙型冠狀病毒1型的關係更為接近),因複製酶保守區域的胺基酸序列相似度小於90%而被認定是獨立物種[1],不過仍有研究者將其視為乙型冠狀病毒1型的一個分型[4]。分子鐘分析顯示兔冠狀病毒HKU14是較近期才起源的病毒,可能於2002年左右才由共同祖先分支[1]。
基因組
兔冠狀病毒HKU14的基因組約長31000nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,另外還有血細胞凝集素酯酶(HE)以及NS2a和NS5a兩種輔助蛋白,其基因順序為1ab-NS2a-HE-S-NS5a-E-M-N。乙型冠狀病毒屬支序A的病毒除人類冠狀病毒HKU1外,在1ab與HE間都有編碼輔助蛋白NS2a,不過兔冠狀病毒HKU14的NS2a並非像支序A的其他病毒一樣是單一開放閱讀框,而是斷裂成3–4個較小的開放閱讀框[1]。
其他兔冠狀病毒
1961年有北歐科學家發現用來培養梅毒螺旋體的兔子被未知病原感染,並偶爾造成死亡,1970年代此感染的死亡率一度高達七成,後來約翰霍普金斯大學研究證實此病原為冠狀病毒,但初步實驗結果顯示此病毒應屬甲型冠狀病毒屬,和兔冠狀病毒HKU14無關[1][5]。
參考文獻
- ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 Lau, S. K. P.; Woo, P. C. Y.; Yip, C. C. Y.; Fan, R. Y. Y.; Huang, Y.; Wang, M.; Guo, R.; Lam, C. S. F.; Tsang, A. K. L.; Lai, K. K. Y.; Chan, K.-H.; Che, X.-Y.; Zheng, B.-J.; Yuen, K.-Y. Isolation and Characterization of a Novel Betacoronavirus Subgroup A Coronavirus, Rabbit Coronavirus HKU14, from Domestic Rabbits. Journal of Virology. 2012, 86 (10): 5481–5496. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.06927-11.
- ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803.
In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).
- ^ Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian; Wang, Ming; Yuen, Kwok-Yung; Sandri-Goldin, R. M. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015, 89 (6): 3076–3092. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02420-14.
- ^ Bakkers, Mark J.G.; Lang, Yifei; Feitsma, Louris J.; Hulswit, Ruben J.G.; de Poot, Stefanie A.H.; van Vliet, Arno L.W.; Margine, Irina; de Groot-Mijnes, Jolanda D.F.; van Kuppeveld, Frank J.M.; Langereis, Martijn A.; Huizinga, Eric G.; de Groot, Raoul J. Betacoronavirus Adaptation to Humans Involved Progressive Loss of Hemagglutinin-Esterase Lectin Activity. Cell Host & Microbe. 2017, 21 (3): 356–366. ISSN 1931-3128. doi:10.1016/j.chom.2017.02.008.
- ^ Small, J. David; Woods, Robert D. Relatedness of Rabbit Coronavirus to Other Coronaviruses 218: 521–527. 1987. ISSN 0065-2598. doi:10.1007/978-1-4684-1280-2_68.