李自芳(1552年—1609年),字遂甫,号育科,江西撫州府东乡县人。明朝政治人物、進士出身。
萬曆十三年(1585年)乙酉科江西鄉試舉人,十七年(1589年)登己丑科進士,授廣東新会县知县,擢国子监助教、刑部云南司主事、刑部郎中、汀州府知府[1]。