BM48-31病毒
BM48-31病毒（BtCoV/BM48-31/Rhi bla/Bulgaria/2008；BM48–31/BGR/2008）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，在保加利亞布腊氏菊头蝠的糞便樣本中發現，其基因組已被完整定序，於2010年發表[1]。
BM48-31病毒
| |
|---|---|
病毒分類 
| |
| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 冠状病毒科 Coronaviridae |
| 属： | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
| 亚属： | SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus |
| 种： | 嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒 SARSr-CoV
|
| 毒株： | BM48-31病毒 BM48-31
|
發現
2008年，研究人員在保加利亞各地採集蝙蝠糞便樣本，經序列分析後發現多種冠狀病毒病毒株，其中屬於SARSr-CoV的可分為兩支，一支皆感染地中海菊头蝠，另一支則包含感染布腊氏菊头蝠、馬鐵菊頭蝠與西班牙菊头蝠的病毒株，有一布腊氏菊头蝠的病毒株被完整定序，即為BM48-31病毒[1]。
BM48-31病毒的基因組長29276nt[2]，與其他SARSr-CoV相較之下，此病毒株缺乏ORF8（2019年發表的肯亞BtKY72病毒亦不具有ORF8[3]），另外此病毒株的ORF3b和其他蝙蝠SARSr-CoV的一樣比SARS病毒的短，不過相較於Rf1等蝙蝠病毒ORF3b胺基酸序列和SARS病毒的相似度超過90%，BM48-31病毒ORF3a胺基酸序列和SARS病毒的相似度僅有約45%[1]。
分類
種系發生學研究結果顯示BM48-31病毒與BtKY72病毒組成一個演化支，兩者基因組序列相似度為81%[3]，此演化支是SARSr-CoV演化樹的基群，與其他SARSr-CoV分家早於SARS-CoV和SARS-CoV-2分家的時間[4][5]。
|
參考文獻
- ^ 1.0 1.1 1.2 Drexler JF, Gloza-Rausch F, Glende J, Corman VM, Muth D, Goettsche M; et al. Genomic characterization of severe acute respiratory syndrome-related coronavirus in European bats and classification of coronaviruses based on partial RNA-dependent RNA polymerase gene sequences.. J Virol. 2010, 84 (21): 11336–49. PMC 2953168
. PMID 20686038. doi:10.1128/JVI.00650-10.
- ^ Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008, complete genome. NCBI. [2021-02-21]. （原始内容存档于2022-03-29）.
- ^ 3.0 3.1 Tao Y, Tong S. Complete Genome Sequence of a Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Coronavirus from Kenyan Bats.. Microbiol Resour Announc. 2019, 8 (28). PMC 6624766 . PMID 31296683. doi:10.1128/MRA.00548-19.
- ^ Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H; et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding.. Lancet. 2020, 395 (10224): 565–574. PMC 7159086 . PMID 32007145. doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8.
- ^ Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2.. Nat Microbiol. 2020, 5 (4): 536–544. PMC 7095448 . PMID 32123347. doi:10.1038/s41564-020-0695-z.
