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凝胶电泳(英語:Gel electrophoresis)或称胶体电泳,也可称为扁平式电泳法(slab electrophoresis),是一大类技术,被科学工作者用于分离不同物理性质(如大小、形状、等电点等)的分子。凝胶电泳通常用于分析用途,但也可以作为制备技术,在采用某些方法,如质谱、聚合酶链式反应、克隆、DNA测序或者免疫印迹检测之前,进行部分提纯分子。
第一个部分,“凝胶”,是指用来分离分子的基质(matrix)。大致上凝胶是个可以被科学家控制多孔性(porosity)的交联聚合物。在分离蛋白质或小的核酸(DNA、RNA,或寡核苷酸)的时候,凝胶通常是用不同浓度的丙烯酰胺和一个交联剂聚合而成,形成不同大小网眼的聚丙烯酰胺网状系统。
分离较大的核酸(超过几百个碱基对时)较常用的基质是纯化的洋菜胶,洋菜胶是海藻(seaweed)的萃取物。
在以上两者里的凝胶都是形成固体但是具孔隙的基质,外观和触感都像透明的果冻。丙烯酰胺,相对于聚丙烯酰胺,是种神经毒素,而且需要用良好药品实验研究规范(Good Laboratory Practices,GLP)处理以避免毒性。