突触小泡蛋白
突触小泡蛋白(英语:synaptobrevins,synaptobrevin isotypes 1-2)是分泌囊泡的小膜嵌入蛋白,分子量为18千道尔顿(kDa),是囊泡相关膜蛋白(VAMP) 家族的一部分。 [1] [2] [3] [4] [5]
Synaptobrevin | |||||||||
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鉴定 | |||||||||
标志 | Synaptobrevin | ||||||||
Pfam | PF00957(旧版) | ||||||||
InterPro | IPR016444 | ||||||||
PROSITE | PDOC00368 | ||||||||
SCOP | 1sfc / SUPFAM | ||||||||
OPM家族 | 197 | ||||||||
OPM蛋白 | 4wy4 | ||||||||
膜蛋白数据库 | 351 | ||||||||
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Synaptobrevin是参与SNARE复合体形成的SNARE蛋白之一。
结构
在核心SNARE复合体的四个α螺旋当中:
- 一个由synaptobrevin贡献
- 一个由syntaxin贡献
- 两个由SNAP-25(在神经元中)贡献。
功能
SNARE蛋白是驱动胞吐作用中膜融合分子机制的关键组分。然而,他们的功能受到多种调节性蛋白(整体叫做SNARE master)的微调。
分类
在用于SNARE蛋白的Q/R命名法中,VAMP/synaptobrevin 家族成员被归类为R-SNAREs ,因为在蛋白质一级结构序列中的特定位置存在精氨酸而得名(与Q-SNAREs相对。他们是位于标的细胞膜上的SNARE,含有谷氨酸)。 Synaptobrevin 在 V/T 命名法中被归类为V-SNARE。V/T命名法是另一种分类方法,以SNARE的位置归类:V-SNAREs位于囊泡上;T-SNAREs 位于标的细胞膜上。[6]
临床重要性
Synaptobrevin会被破伤风痉挛蛋白(一种来自破伤风杆菌的蛋白质,可引起破伤风)降解。
肉毒杆菌(Clostridium botulinum)制造肉毒杆菌毒素,其各种血清型会切下特定神经SNARE蛋白上特定的肽键,而Synaptobrevin正是某些血清型的标的蛋白。
含有该结构域的人类蛋白
SEC22A ; SEC22B ; SYBL1 ; VAMP1;VAMP2 ;VAMP3 ;VAMP4;VAMP5;VAMP8 ;YKT6
参考资料与注释
- ^ Baumert M, Maycox PR, Navone F, De Camilli P, Jahn R. Synaptobrevin: an integral membrane protein of 18,000 daltons present in small synaptic vesicles of rat brain. EMBO J. February 1, 1989, 8 (2): 379–84. PMC 400817 . PMID 2498078. doi:10.1002/j.1460-2075.1989.tb03388.x.
- ^ Bock JB, Scheller RH. SNARE proteins mediate lipid bilayer fusion. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. October 1999, 96 (22): 12227–9. Bibcode:1999PNAS...9612227B. PMC 34255 . PMID 10535902. doi:10.1073/pnas.96.22.12227 .
- ^ Ernst JA, Brunger AT. High resolution structure, stability, and synaptotagmin binding of a truncated neuronal SNARE complex. J Biol Chem. 2003, 278 (10): 8630–6 [2023-05-30]. PMID 12496247. doi:10.1074/jbc.M211889200 . (原始内容存档于2008-04-22).
- ^ Fasshauer D, Sutton RB, Brunger AT, Jahn R. Conserved structural features of the synaptic fusion complex: SNARE proteins reclassified as Q- and R-SNAREs. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. December 1998, 95 (26): 15781–6. Bibcode:1998PNAS...9515781F. PMC 28121 . PMID 9861047. doi:10.1073/pnas.95.26.15781 .
- ^ Weber T, Zemelman BV, McNew JA, Westermann B, Gmachl M, Parlati F, Sollner TH, Rothman JE. SNAREpins: minimal machinery for membrane fusion. Cell. 1998, 92 (6): 759–72. PMID 9529252. S2CID 5637048. doi:10.1016/S0092-8674(00)81404-X .
- ^ Juan S. Bonifacino and Benjamin S. Glick. "The Mechanisms of Vesicle Budding and Fusion." Cell, Vol. 116, 153–166, January 23, 2004,