方尖碑 (生物學)

方尖碑（英文：obelisk)是一種「類病毒樣元素」，首次在2024年1月的一篇預印本中描述，其作者稱「方尖碑形成了自己獨特的系統發育群」^[1]^[2]^[3]，因為它們的RNA序列，由計算機輔助的元轉錄組學發現，與任何其他生命形式的遺傳密碼不同源^[1]。

由於它們與其他生物的關係未知，它們是一個地位未定的群。

分佈和病理學

血清桿菌的革蘭氏染色放大4000倍。

在人類糞便樣本中發現了方尖碑，並且在取自人類口腔的血鏈球菌中也有。一些人類主體攜帶方尖碑超過300天。最初的研究顯示，在所有大陸居住的個體的糞便樣本中，大約有7％的樣本中存在方尖碑，唾液樣本約有50％^[1]。

方尖碑對人類健康的影響，如果有的話，尚待確定^[2]，以及它們的生命周期和複製依賴於什麼因素等問題^[1]。

方尖碑的特徵包括具有約1000個鹼基對的環形RNA基因組組裝件，以及囊括整個基因組的棒狀二級結構。與類病毒相反，它們的RNA被翻譯成蛋白質，在預印本中暫時稱為「oblin」。那裏列出的兩種蛋白質已被命名為Oblin-1和Oblin-2^[1]。

首次結構預測表明，Oblin-1可以結合金屬離子，因此可能參與細胞信號傳導。Oblin-2具有典型的蛋白質複合物結合位點，因此可能與其宿主細胞的酶結合^[2]。

預印本說：「由於有強預測的棒狀二級結構，我們將這組RNA稱為方尖碑-alpha。」...「長1164 nt，棒狀二級結構非常顯著...」^[1]（相對於環形組裝結構的二級結構。）

^ ^1.0 ^1.1 ^1.2 ^1.3 ^1.4 ^1.5 Ivan N. Zheludev; Robert C. Edgar; Maria Jose Lopez-Galiano; Marcos de la Peña; Artem Babaian; Ami S. Bhatt; Andrew Z. Fire. Viroid-like colonists of human microbiomes. BioRxiv. 2024-01-21. PMC 10827157  . PMID 38293115. doi:10.1101/2024.01.20.576352. Wikidata Q124389714 （英語）.
^ ^2.0 ^2.1 ^2.2 Sidik, Saima. 'Wildly weird' RNA bits discovered infesting the microbes in our guts. Nature. 29 January 2024 [31 January 2024]. PMID 38291328. S2CID 267332809. doi:10.1038/d41586-024-00266-7. （原始內容存檔於30 January 2024）.
^ Pennisi, Elizabeth. 'It's insane': New viruslike entities found in human gut microbes. Science. 26 January 2024 [31 January 2024]. doi:10.1126/science.znxt3dk. （原始內容存檔於30 January 2024）.