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方尖碑 (生物学)

此條目介紹的是一种类病毒样元素。关于古代埃及和西亚的一种纪念碑，请见「方尖碑」。

方尖碑（英文：obelisk)是一种“类病毒样元素”，首次在2024年1月的一篇预印本中描述，其作者称“方尖碑形成了自己独特的系统发育群”[1][2][3]，因为它们的RNA序列，由计算机辅助的元转录组学发现，与任何其他生命形式的遗传密码不同源[1]。

由于它们与其他生物的关系未知，它们是一个地位未定的群。

分布和病理学

 
血清杆菌的革兰氏染色放大4000倍。

在人类粪便样本中发现了方尖碑，并且在取自人类口腔的血链球菌中也有。一些人类主体携带方尖碑超过300天。最初的研究显示，在所有大陆居住的个体的粪便样本中，大约有7％的样本中存在方尖碑，唾液样本约有50％[1]。

方尖碑对人类健康的影响，如果有的话，尚待确定[2]，以及它们的生命周期和复制依赖于什么因素等问题[1]。

遗传学和生物化学

方尖碑的特征包括具有约1000个碱基对的环形RNA基因组组装件，以及囊括整个基因组的棒状二级结构。与类病毒相反，它们的RNA被翻译成蛋白质，在预印本中暂时称为“oblin”。那里列出的两种蛋白质已被命名为Oblin-1和Oblin-2[1]。

首次结构预测表明，Oblin-1可以结合金属离子，因此可能参与细胞信号传导。Oblin-2具有典型的蛋白质复合物结合位点，因此可能与其宿主细胞的酶结合[2]。

名称

预印本说：“由于有强预测的棒状二级结构，我们将这组RNA称为方尖碑-alpha。”...“长1164 nt，棒状二级结构非常显著...”[1]（相对于环形组装结构的二级结构。）

参考资料

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 Ivan N. Zheludev; Robert C. Edgar; Maria Jose Lopez-Galiano; Marcos de la Peña; Artem Babaian; Ami S. Bhatt; Andrew Z. Fire. Viroid-like colonists of human microbiomes. BioRxiv. 2024-01-21. PMC 10827157  . PMID 38293115. doi:10.1101/2024.01.20.576352. Wikidata Q124389714 （英语）. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 Sidik, Saima. 'Wildly weird' RNA bits discovered infesting the microbes in our guts. Nature. 29 January 2024 [31 January 2024]. PMID 38291328. S2CID 267332809. doi:10.1038/d41586-024-00266-7. （原始内容存档于30 January 2024）. 
  3. ^ Pennisi, Elizabeth. 'It's insane': New viruslike entities found in human gut microbes. Science. 26 January 2024 [31 January 2024]. doi:10.1126/science.znxt3dk. （原始内容存档于30 January 2024）. 
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