黃鼠冠狀病毒HKU24
中國鼠冠狀病毒HKU24(China Rattus Coronavirus HKU24、ChRCoVHKU24)是乙型冠狀病毒屬的一種病毒,在香港與廣州的大鼠腸道中被發現,於2015年由香港大學的研究人員發表[1]。
黃鼠冠狀病毒HKU24 | |
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病毒分類 | |
(未分级): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
门: | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
纲: | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠状病毒科 Coronaviridae |
属: | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
种: | 黃鼠冠狀病毒HKU24 China Rattus Coronavirus HKU24
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基因組
中國鼠冠狀病毒HKU24的基因組約長31200nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,另外還有血細胞凝集素酯酶(HE)以及NS2a、NS4、NS5與N2等四種輔助蛋白,其基因順序為1ab-NS2-HE-S-NS4-NS5-E-M-N2-N[1]。
演化
序列分析顯示中國鼠冠狀病毒HKU24在乙型冠狀病毒1型(牛冠狀病毒、人類冠狀病毒OC43、豬凝血性腦脊髓炎病毒等)的基部形成一演化支,顯示此病毒可能是乙型冠狀病毒1型(包含兔冠狀病毒HKU14)的姊妹群,和同亞屬中亦感染鼠類的鼠冠狀病毒則關係較遠。此病毒的演化地位顯示可感染多種動物的乙型冠狀病毒1型最早可能是由鼠類病毒演化而來。此病毒與乙型冠狀病毒1型、鼠冠狀病毒、人類冠狀病毒HKU1等共同組成一演化支支序A(lineage A),此演化支的病毒基因組中皆編碼血细胞凝集素酯酶(HE),其他冠狀病毒則無[1][2]。
參見
參考文獻
- ^ 1.0 1.1 1.2 Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian. Sandri-Goldin, R. M. , 编. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015-03-15, 89 (6): 3076–3092 [2022-01-27]. ISSN 0022-538X. PMC 4337523 . PMID 25552712. doi:10.1128/JVI.02420-14. (原始内容存档于2022-05-13) (英语).
- ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820 [2022-01-27]. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. (原始内容存档于2022-05-07) (英语).
In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).