朱孔军(1967年8月—),中华人民共和国马克思主义理论学者、政治人物,籍贯山东省临沂市。
1985年考入中山大学后,他长期在校任职,曾担任学校党委副书记、副校长,2016年1月,转任华南师范大学党委书记。2021年转任广东省教育厅党组书记[1],2023年3月出任同省教育厅长。2024年9月回到中山大学,出任学校党委书记[2]。