藤田嗣章(日语:ふじた つぐあきら,1854年—1941年)日本陆军军人,军医。大正元年(1912年)9月28日接替森鸥外任陆军中将军医总监,任内退伍,获勋一等功三级金鵄勋章。[1]亦曾任日军台湾守备混成旅团军医部长。
明治31年(1898年),于台湾北投温泉区创设“台北陆军卫戍疗养院北投分院”(现为三军总医院北投分院)。明治43年(1910年),出任朝鲜总督府医院长。