小卡哈尔体RNA
小卡哈尔体RNA（Small Cajal body-specific RNA，简称scaRNA）是动物细胞核卡哈尔体中的一类H/ACA匣（H/ACA box）snoRNA[1]，卡哈尔体为细胞组装核小核糖核蛋白（snRNP）的位置。ScaRNA可在卡哈尔体中参与U1剪接体RNA、U2剪接体RNA、U4剪接体RNA、U5剪接体RNA和U12次要剪接体RNA等剪接体RNA的甲基化（2'-O-甲基化）与假尿苷化修饰，另外果蝇的scaRNA还参与28S rRNA的修饰[2]。最早被发现的小卡哈尔体为U85 RNA，于2011年在人类细胞中发现[3]。
| 小卡哈尔体RNA | |
|---|---|
| |
| 小卡哈尔体RNA1的次级结构 | |
| 识别符 | |
| 代号 | SCARNA1 |
| Rfam | RF00553 |
| 其他数据 | |
| RNA类型 | snoRNA、scaRNA |
| 域 | 动物 |
多数snoRNA与scaRNA均位于内含子中，随其他基因一起转录，但有少数scaRNA为RNA聚合酶II独立转录[4]，此类scaRNA中有数个还可被DGCR8和Drosha切割成更小的RNA碎片，这些碎片于核仁中可与其他蛋白组成RNP，可影响snoRNA对rRNA的修饰[5]。
参考文献
- ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T. Human box H/ACA pseudouridylation guide RNA machinery. Molecular and Cellular Biology. 2004, 24 (13): 5797–5807. PMC 480876
. PMID 15199136. doi:10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004.
- ^ Deryusheva S, Gall JG. Novel small Cajal-body-specific RNAs identified in Drosophila: probing guide RNA function. RNA. 2013, 19 (12): 1802–1814. PMC 3884663 . PMID 24149844. doi:10.1261/rna.042028.113.
- ^ Jády BE, Kiss T. A small nucleolar guide RNA functions both in 2′-O-ribose methylation and pseudouridylation of the U5 spliceosomal RNA. The EMBO Journal. 2001, 20 (3): 541–551. PMC 133463 . PMID 11157760. doi:10.1093/emboj/20.3.541.
- ^ Gérard MA, Myslinski E, Chylak N, Baudrey S, Krol A, Carbon P. The scaRNA2 is produced by an independent transcription unit and its processing is directed by the encoding region.. Nucleic Acids Res. 2010, 38 (2): 370–81. PMC 2811027 . PMID 19906720. doi:10.1093/nar/gkp988.
- ^ McLaurin DM, Logan MK, Lett KE, Hebert MD. Molecular determinants that govern scaRNA processing by Drosha/DGCR8.. Biol Open. 2020, 9 (10). PMC 7648615 . PMID 33037012. doi:10.1242/bio.054619.
