CpG岛
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CpG岛(CpG islands)是指DNA上一个区域,此区域含有大量相联的胞嘧啶(C)、鸟嘌呤(G),以及使两者相连的磷酸酯键(p)。哺乳类基因中的启动子上,含有约40%的CpG岛(人类约70%)。一般CpG岛的长度约300到3000个碱基对(bp)。
![](http://images.weserv.nl/?url=//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/10/Cytosine_chemical_structure.png/220px-Cytosine_chemical_structure.png)
![](http://images.weserv.nl/?url=//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d2/Phosphate_Group.svg/220px-Phosphate_Group.svg.png)
![](http://images.weserv.nl/?url=//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0d/Guanine_chemical_structure.png/220px-Guanine_chemical_structure.png)
常用的正式定义是指一个至少含有200bp的区域,其中GC所占比例超过50%,且CpG的观察值/预测值比例必须高于0.6。此部份的CpG岛与基因相连,可用来作为限制酶的辨识位置。
几乎管家基因都含有CpG岛;一般位于基因的5’端区域;大多数CpG岛是甲基化的(70%~80%);CpG岛中的核小体中H1含量低,其他组蛋白被广泛乙酰化,并具有超敏感位点;未甲基化CpG岛可能说明基因具有潜在活性。
参见
- CpG位点(CpG site)
参考文献
- Fatemi, M; Pao, Martha M.; Jeong, Shinwu; Gal-Yam, Einav Nili; Egger, Gerda; Weisenberger, Daniel J.; Jones, Peter A. Footprinting of mammalian promoters: use of a CpG DNA methyltransferase revealing nucleosome positions at a single molecule level. Nucleic Acids Research. 2005-11-27, 33 (20): e176 [2017-06-05]. ISSN 1362-4962. PMC 1292996 . PMID 16314307. doi:10.1093/nar/gni180. (原始内容存档于2019-06-09).
- Saxonov, S; Berg, P, Brutlag, DL. A genome-wide analysis of CpG dinucleotides in the human genome distinguishes two distinct classes of promoters. PNAS. January 2006, 103 (5) [2007-02-23]. PMID 16432200. (原始内容存档于2006-05-08).
- Feil, R; Berger, F. Convergent evolution of genomic imprinting in plants and mammals. Trends in Genetics. May 2007, 23 (4).