普氏蹄蝠冠狀病毒Zhejiang2013
蹄蝠乙型冠狀病毒浙江2013(Bat Hp-betacoronavirus/Zhejiang2013、BtHp-BetaCoV/ZJ2013)是乙型冠狀病毒屬的一種病毒,於2013年在中國浙江的普氏蹄蝠中發現。此病毒與乙型冠狀病毒屬支序B的病毒(包括嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒SARS-CoV、嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型SARS-CoV-2等)關係接近,為其姊妹群[1]。
普氏蹄蝠冠狀病毒Zhejiang2013 | |
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病毒分類 | |
(未分級): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
門: | 小核糖病毒門 Pisuviricota |
綱: | 小南嵌套病毒綱 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠狀病毒科 Coronaviridae |
屬: | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
種: | 普氏蹄蝠冠狀病毒Zhejiang2013 Bat Hp-betacoronavirus/Zhejiang2013
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基因組
蹄蝠乙型冠狀病毒ZJ2013的基因組長約31500nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,另外還有ORF2、ORF4、ORF7與ORF8等四個開放閱讀框編碼輔助蛋白,其基因順序為1ab-ORF2-S-ORF4-E-M-ORF7-ORF8-N[2]。其中ORF2為此病毒特有,可能與刺突蛋白有關,此開放閱讀框中含有穿膜的區域與信號肽,顯示其可能是一種病毒表面的蛋白[1]。
分類
序列分析結果顯示BtHp-BetaCoV/ZJ2013與SARS-CoV、SARS-CoV-2等乙型冠狀病毒屬支序B的病毒關係接近,為其姊妹群,不過其核苷酸序列的相似度僅有58%。乙型冠狀病毒屬中,上述病毒組成的演化支和支序D的病毒(果蝠冠狀病毒HKU9、果蝠冠狀病毒GCCDC1)為姊妹群,與其他病毒關係則較遠[1][3]。
有學者將此病毒單獨歸入Hibecovirus亞屬中,將SARS-CoV、SARS-CoV-2和相關蝙蝠病毒組成亞屬Sarbecovirus,將HKU9與GCCDC1(支序D)組成亞屬Nobecovirus[3]。
參考文獻
- ^ 1.0 1.1 1.2 Wu, Zhiqiang; Yang, Li; Ren, Xianwen; He, Guimei; Zhang, Junpeng; Yang, Jian; Qian, Zhaohui; Dong, Jie; Sun, Lilian; Zhu, Yafang; Du, Jiang; Yang, Fan; Zhang, Shuyi; Jin, Qi. Deciphering the bat virome catalog to better understand the ecological diversity of bat viruses and the bat origin of emerging infectious diseases. The ISME Journal. 2015, 10 (3): 609–620. ISSN 1751-7362. doi:10.1038/ismej.2015.138.
- ^ Bat Hp-betacoronavirus/Zhejiang2013, complete genome. NCBI. [2020-04-01]. (原始內容存檔於2021-05-26).
- ^ 3.0 3.1 Lu, Roujian; Zhao, Xiang; Li, Juan; Niu, Peihua; Yang, Bo; Wu, Honglong; Wang, Wenling; Song, Hao; Huang, Baoying; Zhu, Na; Bi, Yuhai; Ma, Xuejun; Zhan, Faxian; Wang, Liang; Hu, Tao; Zhou, Hong; Hu, Zhenhong; Zhou, Weimin; Zhao, Li; Chen, Jing; Meng, Yao; Wang, Ji; Lin, Yang; Yuan, Jianying; Xie, Zhihao; Ma, Jinmin; Liu, William J; Wang, Dayan; Xu, Wenbo; Holmes, Edward C; Gao, George F; Wu, Guizhen; Chen, Weijun; Shi, Weifeng; Tan, Wenjie. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet. 2020, 395 (10224): 565–574. ISSN 0140-6736. doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8.