逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶
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逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶(英語:Retroviral aspartyl protease或retropepsins)是來自逆轉錄病毒、反轉錄轉座子和杆狀DNA病毒(植物雙鏈DNA病毒)的單域天冬氨酸蛋白酶。這些蛋白酶通常是較大的DNA聚合酶或群特異性抗原的一部分。逆轉錄病毒蛋白酶與雙結構域真核天冬氨酸蛋白酶的單個結構域同源,例如胃蛋白酶、組織蛋白酶和腎素(Pfam PF00026;MEROPS A1)。胃蛋白酶是MEROPS A2,AA家族的成員。(所有已知的成員都是內肽酶)
逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶 | |||||||||
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鑑定 | |||||||||
標誌 | RVP | ||||||||
Pfam | PF00077(舊版) | ||||||||
InterPro | IPR001995 | ||||||||
PROSITE | PDOC00128 | ||||||||
MEROPS | A2 | ||||||||
SCOP | 1ida / SUPFAM | ||||||||
OPM家族 | 100 | ||||||||
OPM蛋白 | 2q63 | ||||||||
膜蛋白數據庫 | 532 | ||||||||
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逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶僅作為蛋白二聚體具有活性,因為每個同源二聚體都對應於真核雙葉酶的一半。這兩部分各貢獻一個催化性天冬氨酰殘基。[1]
逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶作為DNA聚合酶多聚蛋白的一部分合成,該多聚蛋白包含天冬氨酰蛋白酶、逆轉錄酶、核糖核酸酶H和整合酶。DNA聚合酶多聚蛋白經過特定的酶促切割以產生成熟的蛋白質。
並非所有由DNA聚合酶產生的逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶都是嚴格意義上的逆胃蛋白酶。來自泡沫逆轉錄病毒亞科的海綿蛋白酶的差異足以產生自己的家族,MEROPS A9。在AA家族中可以找到許多其他示例。
含有該結構域的人類蛋白質
參考文獻
- ^ Pettit, Steven C.; Everitt, Lorraine E.; Choudhury, Sumana; Dunn, Ben M.; Kaplan, Andrew H. Initial Cleavage of the Human Immunodeficiency Virus Type 1 GagPol Precursor by Its Activated Protease Occurs by an Intramolecular Mechanism. Journal of Virology. 2004-8, 78 (16) [2022-09-11]. ISSN 0022-538X. PMID 15280456. doi:10.1128/JVI.78.16.8477-8485.2004. (原始內容存檔於2022-09-11).