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生物信息學
數據庫
測序數據庫：
GenBank
、
European Nucleotide Archive
（
英語
：
European Nucleotide Archive
）
、
日本DNA數據庫
(DDBJ)
輔助數據庫：
UniProt
, database of protein sequences grouping together
Swiss-Prot
,
TrEMBL
和
蛋白質信息資源
（
英語
：
Protein Information Resource
）
其它數據庫：
蛋白質資料庫
,
Ensembl
, 和
InterPro
（
英語
：
InterPro
）
專項基因組數據庫：
酵母基因組數據庫
（
英語
：
Saccharomyces Genome Database
）
、
FlyBase
（
英語
：
FlyBase
）
、
VectorBase
（
英語
：
VectorBase
）
、
PomBase
、
WormBase
（
英語
：
WormBase
）
、
PHI-base
（
英語
：
PHI-base
）
、
擬南芥信息資源
（
英語
：
The Arabidopsis Information Resource
）
與
斑馬魚信息網
（
英語
：
Zebrafish Information Network
）
軟件
BLAST
Bowtie
Clustal
EMBOSS
（
英語
：
EMBOSS
）
HMMER
（
英語
：
HMMER
）
MUSCLE
SAMtools
（
英語
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SAMtools
）
TopHat
（
英語
：
TopHat (bioinformatics)
）
其它
服務器：
ExPASy
（
英語
：
ExPASy
）
本體論：
基因本體
機構
歐洲生物信息研究所
(EMBL-EBI)
歐洲分子生物學實驗室
(EMBL)
美國國家生物技術信息中心
（NCBI）
瑞士生物信息學研究所
（
英語
：
Swiss Institute of Bioinformatics
）
日本
國立遺傳學研究所
博德研究所
（
英語
：
Broad Institute
）
維康桑格研究所
斯克里普斯研究所
(TSRI)
文件格式
FASTA格式
FASTQ格式
斯德哥爾摩格式
（
英語
：
Stockholm format
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有關議題
計算生物學
分子系統發生學
測序
序列比對
分類
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