澎湖縣政府稅務局是中華民國澎湖縣政府所屬一級行政機關,1963年7月1日揭牌成立,最初隸屬臺灣省政府財政廳稅務局,2000年元月份起改隸澎湖縣政府。自2015年起,澎湖縣稅務局下轄三室、五科,主要業務為稽查、徵收地方稅務等事宜。