卜理牙敦（？—1352年），元朝北庭人。
卜理牙敦官至山南廉訪使，治所在中興路。中興路是江漢藩屏，卜理牙治理所部，恩威並至。至正十二年（1352年），紅巾軍攻打中興，卜理牙敦率兵抵抗，射敵多死，敵人稍退。第二天，再擁眾來攻打東門，卜理牙敦全力與敵作戰，被擒獲，不屈而死。第二天，紅巾軍攻克中興，中興判官上都遇害。
