LIM結構域
LIM結構域(英語:LIM domain)是一種蛋白質結構域,由兩個疏水氨基酸殘基連接兩個鋅指結構組成[1],其命名來自於最早發現這一結構域的三種蛋白(Lin11, Isl-1 & Mec-3)的首字母[2]。LIM結構域介導蛋白質交互作用,參與細胞骨架組建,在器官發育和腫瘤發生中有重要作用。
LIM domain | |||||||||||
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鑑定 | |||||||||||
標誌 | LIM | ||||||||||
Pfam | PF00412(舊版) | ||||||||||
InterPro | IPR001781 | ||||||||||
PROSITE | PDOC50178 | ||||||||||
SCOP | 1ctl / SUPFAM | ||||||||||
CDD | cd08368 | ||||||||||
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除了關鍵氨基酸如結合鋅的半胱氨酸和中心的疏水氨基酸外,LIM結構域的氨基酸序列高度可變,其通式如下:
[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–19-[W]-[H]-[X]2–4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–20-C-[X]2–4-[C]
參考文獻
- ^ Kadrmas JL, Beckerle MC. The LIM domain: from the cytoskeleton to the nucleus. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004, 5 (11): 920–31. PMID 15520811. doi:10.1038/nrm1499.
- ^ Bach I. The LIM domain: regulation by association. Mech. Dev. 2000, 91 (1–2): 5–17. PMID 10704826. doi:10.1016/S0925-4773(99)00314-7.