LIM結構域

LIM結構域(英語:LIM domain)是一種蛋白質結構域,由兩個疏水氨基酸殘基連接兩個鋅指結構組成[1],其命名來自於最早發現這一結構域的三種蛋白(Lin11, Isl-1 & Mec-3)的首字母[2]。LIM結構域介導蛋白質交互作用,參與細胞骨架組建,在器官發育和腫瘤發生中有重要作用。

LIM domain
Pinch蛋白的第四個LIM結構域,鋅原子為灰色
鑑定
標誌LIM
PfamPF00412舊版
InterPro英語InterProIPR001781
PROSITE英語PROSITEPDOC50178
SCOP英語Structural Classification of Proteins1ctl / SUPFAM
CDD英語Conserved Domain Databasecd08368

除了關鍵氨基酸如結合半胱氨酸和中心的疏水氨基酸外,LIM結構域的氨基酸序列高度可變,其通式如下:

[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–19-[W]-[H]-[X]2–4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2–4-[C]-[X]13–20-C-[X]2–4-[C]

LIM結構域的圖示

參考文獻

  1. ^ Kadrmas JL, Beckerle MC. The LIM domain: from the cytoskeleton to the nucleus. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004, 5 (11): 920–31. PMID 15520811. doi:10.1038/nrm1499. 
  2. ^ Bach I. The LIM domain: regulation by association. Mech. Dev. 2000, 91 (1–2): 5–17. PMID 10704826. doi:10.1016/S0925-4773(99)00314-7.