平井毓太郎(日语:ひらい いくたろう,1865年11月28日[1]—1945年[2]1月12日)是日本医生,曾任京都帝国大学教授,旧姓木场,三重县出身。
平井毓太郎曾于1914年提名野口英世角逐诺贝尔奖。