毛三元(?—1850年),四川省潼川府盐亭县(今四川省盐亭县),清朝军事将领、武进士出身。
道光十一年,武举中式;道光十二年,登武进士,授蓝翎侍卫。道光十九年,任云南景蒙营中军守备。道光二十二年,署维西协中军都司。道光二十三年兼任游击。道光二十五年,任元江营中军守备,署腾越镇标左营都司。道光二十七年,署右营都司。道光二十八年,署普洱镇标中营守备。道光三十年,赠云骑尉[1]。