准噶尔征服阿尔蒂沙尔
征服
塔里木盆地的定居突厥语穆斯林由最初察合台汗国统治，17世纪时纳克什班迪教团的和卓们已经取代了察合台汗的权威，和卓们分为白山派和黑山派，黑山派击败了阿帕克和卓，他逃往西藏请求五世达赖喇嘛干预，而噶尔丹作为他的代理人于1680年征服塔里木盆地和吐鲁番盆地，以阿帕克和卓作为傀儡统治者。
统治
准噶尔噶尔丹汗在1680年派出120000人和白山派士兵入侵塔里木盆地，轻松地征服了塔里木盆地，击败和杀害了叶尔羌汗国伊思玛业勒汗的儿子巴拜苏丹，杀死了将军伊瓦兹波伯克，并把伊思玛业勒流放到伊犁。
阿卜都里什特被噶尔丹选为傀儡统治者，但阿帕克和卓和他之间的冲突导致1682年叶尔羌发生暴乱，阿卜都里什特投奔清朝，准噶尔改立他的幼弟马哈麻特·额敏继位。
准噶尔自1680年作为塔里木盆地的宗主后，用叶尔羌汗与和卓作为他们的傀儡统治者，另一方面又以他们的儿子作人质囚禁于伊犁确保他们的忠诚。与此同时准噶尔又不断搜刮维吾尔族的财富，包括水利税，牲口税，水果税，人头税，土地税，树木和草税，金银税，营业税，还勒索了额外的棉花，白银，黄金。每年准噶尔从喀什噶尔人提取67000腾格银税，如果他们拥有果园，人们不得不付出水果税，准噶尔使者每次到南疆，也要强奸妇女，抢劫和偷窃财物和牲畜。
准噶尔同时把一些维吾尔人强行转移到伊犁，作为生产粮食的农奴，即塔兰奇。
准噶尔对回部的统治，直到满清打败准噶尔后才终止。
参考文献
- Kim, Kwangmin (2008). Saintly Brokers: Uyghur Muslims, Trade, and the Making of Qing Central Asia, 1696--1814. University of California, Berkeley. ProQuest. ISBN 1109101260. Retrieved 10 March 2014