用户:Lihaochang678/DIY生物学


DIY生物学

DIY生物学DIYbiologicalDIYbio )是一种生物技术社会运动,其中个人、社区和小型组织使用与传统研究机构相同的方法研究生物学和生命科学DIY生物学主要由接受过学术界或企业有限研究培训的个人进行,然后他们指导和监督其他很少或根本没有接受过正式培训的 DIY 生物学家。这可以作为一种爱好,作为社区学习和开放科学创新非营利性努力,或者为了营利而开展业务

其他术语也与 DIY 生物学界相关。生物黑客湿软件黑客这两个术语强调了与黑客文化黑客道德的联系。 [1]黑客一词的原始含义是寻找新的、聪明的方法来做事。研磨机机身改造社区也使用“生物黑客”一词,该术语被认为与“DIY”生物学运动相关但又不同。 [2]生物庞克一词强调该运动的技术进步、政治和艺术元素。

历史

“生物黑客”一词以及 DIY 生物学的概念早在 1988 年就已为人所知。 [3] [4] [5]

生物黑客技术早在 2005 年就通过简单的基本实验演示进入了旧金山程序员和创客社区。随着 DIYbio 实验成为SuperHappyDevHouse[6]黑客的焦点,这种爱好获得了额外的动力。

2005 年,罗布·卡尔森 (Rob Carlson) 在《连线》杂志上发表的一篇文章中写道:“车库生物学时代已经来临。想参与吗?花点时间在eBay上给自己买一个实验室。” [7]同年,他建立了一个车库实验室,致力于他之前在加利福尼亚州伯克利分子科学研究所[8]工作过的一个项目。 [9]

2008年,Jason Bobe和Mackenzie Cowell创立了DIYbio组织[10],并召开了第一次会议。 [11]

2010 年, Genspace[12]开设了第一个社区生物学实验室, [13]十个月后, BioCurious , [14]和Victoria Makerspace[15]紧随其后。许多其他实验室和组织也紧随其后,包括但不限于加利福尼亚州奥克兰的反文化实验室、马里兰州巴尔的摩的巴尔的摩地下科学空间、加利福尼亚州洛杉矶的 TheLab 和科罗拉多州丹佛市的丹佛生物实验室。

据估计,2014年全球已有50个DIY生物实验室。 [16] :119

2016 年,第一届专门关注生物黑客的会议宣布将于 9 月在加利福尼亚州奥克兰举行。 [17]

方面

DIYbio 运动旨在改变这样一种观念,即一个人必须是一名拥有高级学位的学者才能为生物学界做出重大贡献。它允许大量小型组织和个人参与研发,传播知识比盈利更重要。 [18]近年来,有各种各样的 DIY 健康生活方式,其中许多还侧重于不同的简单方法来生物黑客思想、 [19]身体、新陈代谢[20] [21]然后睡觉。 [22]

DIY 生物学的动机包括(但不限于)降低成本、娱乐、医学、生物黑客、延长寿命和教育。最近的工作结合了ArduinoRepRap 3D 打印机等微控制器的开源硬件,开发出了非常低成本的科学仪器[23]

社区实验室空间

许多组织都维护着类似于湿实验室创客空间的实验室,为成员提供设备和用品。许多组织还开设课程并提供培训。会员可以支付一定费用(通常在 50 至 100 美元之间)加入一些空间并自行进行实验。 [24] [25] [26]

开源设备

DIY 生物学运动试图为任何人(包括非专业人士)提供进行生物工程所需的工具和资源。爱尔兰生物黑客 Cathal Garvey 开发的首批开源实验室设备之一是 Dremelfuge,它使用连接到Dremel德雷梅尔(Dremel)​(英语[27]旋转工具的3D 打印管支架来高速旋转管,取代了通常昂贵的离心机。 [28] PCR 机等许多其他设备已被广泛重建。 [29] [30] [31]近年来,更复杂的设备被创建,例如由 GaudiLabs 开发的 OpenDrop 数字微流体平台[32]和 DIY NanoDrop [33] 。 Opentrons 生产开源软件、价格实惠的实验室机器人,并以 Genspace 的 DIY 生物学合作起步。 [34] Incuvers 为细胞研究制造遥测室,价格实惠,并且可以完全定制其环境。 OpenCell开放细胞(OpenCell)​(英语 [35]是一家位于伦敦的生物技术实验室提供商,定期举办生物黑客马拉松,以帮助鼓励更多的开源开发。 [36]

宣传

大多数生物黑客的倡导都是关于实验的安全性、可访问性和未来的合法性。伍德罗·威尔逊中心的托德·奎肯提出,通过安全和自治,DIY 生物学家将不需要监管。 [37]乔赛亚·扎纳 (Josiah Zayner)提出,安全性是生物黑客攻击所固有的,并且可访问性应该是最重要的问题,因为生物黑客攻击中社会和少数民族的代表性严重不足。 [38]

研究主题

许多生物黑客项目围绕生命改造、分子工程和基因工程展开。 [39]

生物信息学

生物信息学是 DIY 生物学研究的另一个热门目标。和其他领域一样,DIY生物学可以使用很多编程语言,但使用的大多数都是具有大型生物信息学的语言。

示例包括BioPerlBioPython ,它们分别使用PerlPython语言。

基因工程

基因工程师是生物黑客的一个亚文化,因为最容易实现的生物黑客形式之一是通过工程微生物或植物来实现的。实验范围可以从使用质粒到荧光细菌,利用光控制细菌中的基因表达, [40]甚至使用CRISPR来改造细菌或酵母的基因组。 [41]

药品

医疗保健和药品的获取受限促使生物黑客开始在医学相关领域进行实验。开放胰岛素[42]项目旨在通过创建表达和纯化的开源协议,使重组蛋白胰岛素更易于获取。 [43]其他涉及医学治疗的实验包括全身微生物组[44]移植[45]和为糖尿病患者创建开源人工胰腺[46] ,如OpenAPS[47] 、Loop [48]和 AndroidAPS。开放式APS(OpenAPS)​(英语 [49]

植入物

磨床者是生物黑客的一个亚文化,他们专注于将技术[50]或化学物质[51]植入体内,以增强或改变身体的功能。

一些生物黑客现在可以利用在皮肤上振动的磁性植入物来感知自己所面朝的方向。 [52]

艺术

2000 年,备受争议、自称“转基因艺术家”的爱德华多·卡茨[53] (Eduardo Kac)借用了生物技术和遗传学研究人员的标准实验室工作,以利用和批判这些科学技术。在卡茨唯一一件据称是转基因艺术的作品中,艺术家声称自己与一家法国实验室(隶属于法国国家农业研究所)合作,获得了一只绿色荧光兔子:在兔子体内植入了一种水母(维多利亚多管水母)的绿色荧光蛋白基因,这样这只兔子在紫外线下就会发出绿色荧光。这件自称是“GFP 兔子”的作品,Kac 称之为Alba 。 Kac 的这一说法遭到了实验室科学家的质疑,他们指出,他们之前已经在许多其他动物(猫、狗等)上进行了完全相同的实验(即插入水母 GFP 蛋白编码基因),并没有在 Kac 的指导下创造出Alba (研究人员只知道它是“兔子编号 5256”)。因此,该实验室保留了其创造和资助的转基因兔子,并且“转基因艺术”从未按计划在阿维尼翁数字艺术节 [2000] 上展出。卡克声称他的兔子是第一只以艺术的名义创作的 GFP 兔子,他利用这场争议发起了“释放阿尔巴”运动,将这一问题宣传为变相审查问题。这位艺术家的网站上出现了一张经过修改的照片,照片中他手抱一只日光绿色的兔子。 [54]批判艺术团的成员围绕这一问题撰写了书籍并进行了多媒体表演干预,包括《肉体机器》(关注体外受精身体监控和自由优生学)和《新夏娃崇拜》 (为了分析如何用他们的话来说,“科学是生产知识的权威机构,并倾向于取代西方传统基督教的这一特定社会功能”)。 [55]

批评和担忧

生物黑客与合成生物学基因工程一样,遭遇了许多同样的批评,此外,还存在与该工作分散性和非机构性有关的其他担忧,涉及缺乏专业人员或政府监督的潜在危害。由于担心生物黑客在无人监控的车库实验室中制造病原体,联邦调查局(FBI) 于 2009 年开始派代表参加 DIYbio 会议[56]一些成员因从事无害微生物研究而遭到逮捕和起诉,如艺术活动家史蒂夫·库尔茨。批评人士指责美国政府实施政治压制,他们认为美国政府利用9/11 事件后的反恐权力,恐吓艺术家及其他利用艺术批判社会的人士。 [57]

现有的法规并不专门针对这一领域,因此生物黑客有意或无意地制造和释放致病生物的可能性已成为一个令人担忧的问题,例如,2005 年武装部队病理研究所的研究人员重现了 1917 年流感病毒的精神。 [58]在美国,联邦调查局大规模杀伤性武器局与美国科学促进会国家生物安全科学顾问委员会合作,召开了一系列会议讨论生物安全问题,其中包括业余生物学家的讨论以及如何管理生物安全对社会造成的风险。 [59] [60] :8.16在美国国立卫生研究院,国家生物安全科学顾问委员会[61]牵头开展对公众进行“值得关注的双重用途研究”教育的活动,例如通过“科学安全保障”等网站。 [62] 2011 年, DIYbio组织了会议,试图为生物黑客制定道德准则。 [63]

虽然反对者认为 DIY 生物学家需要某种形式的监督,但支持者认为统一的监督是不可能的,防止事故或恶意行为的最好方法是鼓励一种透明的文化,本质上,DIY 生物学家会受到其他生物黑客的同行评审。 [64] DIYbio认为,人们应该通过加强研究和教育来应对对潜在危害的担忧,而不是关闭分布式生物技术对人类健康、环境和世界各地生活水平产生的深远积极影响的大门。 [65]由于缺乏此类商业模式的先例,DIYbio 创始人将此视为在监管和安全政策方面进行创新的机会。 [66]

团体和组织

也可以看看

参考

  1. ^ Hicks, Jennifer. 生物黑客爱好者. Forbes. 2014-03-15 [2016-06-19]. 
  2. ^ Michels, Spencer. 什么是生物黑客以及我们为什么要关心?. PBS NewsHour. 2014-09-23 [2015-10-30]. 
  3. ^ Katz, Sylvan. 论坛:玫瑰是黑色的,紫罗兰是绿色的——业余基因工程师的出现. New Scientist. 6 January 1990 [2015-10-25]. 
  4. ^ Katz, J. S. 不禁止的就是强制性的. Education. 1990, 4 (1). ISSN 0955-6621. 
  5. ^ Schrage, Michael. 在你的地下室扮演上帝. The Washington Post. 1988-01-31 [2015-10-25]. ISSN 0190-8286. 
  6. ^ SuperHappyDevHouse ( SHDH ) 是一系列国际社交活动,组织者最初将其设想为黑客聚会。
  7. ^ Carlson, Rob. 自己拼接:谁需要遗传学家? 建立自己的实验室。. Wired. May 2005. 
  8. ^ 分子科学研究所( MSI ) 现位于加利福尼亚州米尔皮塔斯,由Sydney Brenner于 1996 年在加利福尼亚州伯克利创立。
  9. ^ Ledford, Heidi. 车库:生活黑客. Nature. 2010, 467 (7316): 650–2. PMID 20930820. doi:10.1038/467650a . 
  10. ^ DIYbio是一个非正式的伞式组织,面向活跃于 DIY生物学领域的个人和当地团体,包括网站和电子邮件列表。
  11. ^ 美国公共广播公司新闻时间. YouTube. 31 Dec 2008. (原始内容存档于2021-12-20). 
  12. ^ Genspace是一家位于纽约布鲁克林的非营利组织和社区生物学实验室。
  13. ^ Mosher, Dave. DIY 生物技术黑客空间在纽约开业. Wired. 2010-12-16 [2017-07-25]. 
  14. ^ BioCurious 正式开业——测试 DNA、建造设备、寻找联合创始人等等……. Make Magazine. 2011-10-14 [2017-07-25]. 
  15. ^ Victoria Makerspace是一个生物社区实验室
  16. ^ Dariusz Jemielniak; Aleksandra Przegalinska. 协作社会. MIT Press. 18 February 2020. ISBN 978-0-262-35645-9. 
  17. ^ 生物黑客地球会议. Biohack the Planet. [2016-06-19]. 
  18. ^ 罗布·卡尔森谈合成生物学. The Economist. (原始内容存档于2011-10-09). 
  19. ^ Wu, Chen-Yi; Hu, Hsiao-Yun; Chow, Lok-Hi; et al. 抗痴呆和促智治疗对痴呆患者死亡率的影响:台湾基于人群的队列研究. PLOS ONE. 22 June 2015, 10 (6): e0130993. Bibcode:2015PLoSO..1030993W. PMC 4476616 . PMID 26098910. doi:10.1371/journal.pone.0130993 . 
  20. ^ Singh, Honey. 如何对你的新陈代谢进行生物黑客攻击?. Do BioHacking. 2 February 2020. 
  21. ^ Prigent, Sylvain; Frioux, Clémence; Dittami, Simon M.; Thiele, Sven; Larhlimi, Abdelhalim; Collet, Guillaume; Gutknecht, Fabien; Got, Jeanne; Eveillard, Damien; Bourdon, Jérémie; Plewniak, Frédéric. Meneco,一种基于拓扑的间隙填充工具,适用于退化的全基因组代谢网络. PLOS Computational Biology. 27 January 2017, 13 (1): e1005276. Bibcode:2017PLSCB..13E5276P. PMC 5302834 . PMID 28129330. doi:10.1371/journal.pcbi.1005276 . 
  22. ^ Anderson, Jason R.; Hagerdorn, Payton L.; Gunstad, John; Spitznagel, Mary Beth. 使用咖啡来弥补睡眠不足:对警惕性的影响以及对工作场所表现的影响. Applied Ergonomics. July 2018, 70: 142–147. PMID 29866304. S2CID 46929880. doi:10.1016/j.apergo.2018.02.026. 
  23. ^ Pearce, Joshua M. 使用免费的开源硬件构建研究设备. Science. 14 September 2012, 337 (6100): 1303–1304. Bibcode:2012Sci...337.1303P. PMID 22984059. S2CID 44722829. doi:10.1126/science.1228183. 
  24. ^ BUGSS会员. BUGSS. [2016-06-17]. (原始内容存档于2017-08-25). 
  25. ^ 生物好奇会员. Biocurious. [2016-06-17]. 
  26. ^ 反文化实验室会员资格. Counter Culture Labs. [2016-06-17]. 
  27. ^ 是一个跨国电动工具品牌,专注于家居装修和业余爱好应用。
  28. ^ DremelFuge – 一款用于旋转工具的一体式离心机. Thingiverse. 2009-12-23 [2016-06-17]. 
  29. ^ Jankowski, Tito. DNA 现在可以 DIY:OpenPCR 运往全球. Make. 2011-07-06. 
  30. ^ 袖珍 PCR 价格低廉. LavaAmp. [2015-10-26]. (原始内容存档于2015-11-06). 
  31. ^ 咖啡杯 - PCR 热循环仪成本低于 350 美元. Instructables. 2009-06-13 [2016-06-17]. 
  32. ^ OpenDrop. OpenDrop. [2016-06-17]. 
  33. ^ DIY纳米水滴. DIY NanoDrop. Hackteria. [2016-06-17]. 
  34. ^ Landoni, Boris. Interview to Open Trons | Open Electronics. 开源电子产品. 11 July 2014 [1 November 2016]. 
  35. ^ OpenCell是位于伦敦的一个实验室。
  36. ^ Open Cell 每月举办一次生物黑客马拉松,以开发设备、软件和产品,以打造更好、更实惠的生物实验室。. OpenCell.bio. OpenCell. [2019-08-17]. 
  37. ^ Todd Kuiken. 治理:向 DIY 生物学家学习. Nature Magazine. 2016-03-09, 531 (7593): 167–168. Bibcode:2016Natur.531..167K. PMID 26961642. doi:10.1038/531167a . 
  38. ^ Yin, Steph. DIY厨房CRISPR是阶级问题吗?. Popular Science. 2016-05-03 [2016-06-19]. 
  39. ^ Hicks, Jennifer. 生物黑客爱好者. Forbes. 2014-03-15 [2016-06-19]. 
  40. ^ 生物好奇聚会. Meetup. 2016-06-25 [2016-06-17]. 
  41. ^ Krieger, Lisa M. 湾区生物学家的基因编辑套件让DIY者在厨房餐桌上扮演上帝. San Jose Mercury News. 2016-01-11 [2016-06-17]. 
  42. ^ 开放胰岛素项目是一个由研究人员和倡导者组成的社区,致力于开发一种开源协议,用于生产价格实惠、定价透明且归社区所有的胰岛素。
  43. ^ Ossola, Alexandra. 这些生物黑客正在创造开源胰岛素. Popular Science. 2015-11-18 [2016-06-17]. 
  44. ^ 微生物组(源自古希腊语 μικρός (mikrós)  “小”和βίος (bíos)  “生命”)是通常可以在任何特定栖息地一起生活的微生物群落。 Whipps等人于 1988 年对其进行了更精确的定义。 “一个特征性的微生物群落,占据一个相当明确的栖息地,具有独特的理化特性。
  45. ^ Duhaime-Ross, Arielle. 苦涩的药丸. The Verge. 2016-05-04. 
  46. ^ Linebaugh, Kate. 精通技术的家庭使用自制的糖尿病设备. Wall Street Journal. 2016-05-09. 
  47. ^ 开放式人工胰腺系统( OpenAPS ) 项目是一个免费的开源项目,旨在让每个人都能使用基本的人工胰腺系统 (APS) 技术。
  48. ^ LoopDocs. loopkit.github.io. [2022-07-25]. 
  49. ^ 欢迎使用 AndroidAPS 文档 — AndroidAPS 3.0 文档. androidaps.readthedocs.io. [2022-07-25]. 
  50. ^ Neifer, Anna. 生物黑客正在将 LED 植入他们的皮肤下. Motherboard. 2015-11-09. 
  51. ^ Dvorsky, George. 这位生物黑客使用眼药水让自己暂时获得夜视能力. Gizmodo. 2016-03-27. 
  52. ^ Thaddeus-Johns, Josie. 认识第一批感知北方位置的人类. The Guardian. 2017-01-06 [2018-06-02] (英语). 
  53. ^ 爱德华多·卡克(Eduardo Kac,1962 年 7 月 3 日出生)是一位巴西和美国当代艺术家,其作品涵盖多种艺术形式,包括表演艺术、诗歌、全息术、互动艺术、数字和在线艺术以及生物艺术。
  54. ^ Dickey, Christopher. 我爱我的发光兔子. April 2001. 
  55. ^ 批判艺术团. critical-art.net. [2015-11-20]. (原始内容存档于2015-11-13). 
  56. ^ Ledford, Heidi. 车库:生活黑客. Nature. 2010, 467 (7316): 650–2. PMID 20930820. doi:10.1038/467650a . 
  57. ^ The Associated Press. 科学家承认为“生物艺术”邮寄细菌. First Amendment Center. October 29, 2007. (原始内容存档于2009-02-10). 
  58. ^ 1918年流感病毒复活. Nature. October 2005, 437 (7060): 794–5. Bibcode:2005Natur.437..794.. PMC 7095040 . PMID 16208326. doi:10.1038/437794a. 
  59. ^ Zimmer, Carl. 业余爱好者对创造突变病毒产生了新的恐惧. The New York Times. March 5, 2012. 
  60. ^ 由美国科学促进会与美国大学协会、公立和赠地大学协会以及联邦调查局共同编写Bridging Science and Security for Biological Research: A Discussion about Dual Use Review and Oversight at Research Institutions Report of a Meeting September 13–14, 2012 互联网档案馆存档,存档日期2012-10-28.
  61. ^ NSABB Official Website
  62. ^ Science Safety Security official website
  63. ^ 行为准则在业余生物学界的作用. [4 February 2014]. 
  64. ^ Boustead, Greg. 生物黑客爱好者. Seed Magazine. December 11, 2008. 原始内容存档于2019-10-06. 
  65. ^ DIYbio/FAQ. 
  66. ^ 美国公共广播公司新闻时间. YouTube. 31 Dec 2008. (原始内容存档于2021-12-20). 
  67. ^ 贼醋集体是一个无政府主义 生物黑客组织,由迈克尔·劳弗 (Michael Laufer)于 2015 年创立。
  68. ^ 开放胰岛素项目是一个由研究人员和倡导者组成的社区,致力于开发一种开源协议,用于生产价格实惠、定价透明且归社区所有的胰岛素。