伊萨克·科穆宁是拜占庭皇帝阿莱克修斯一世与皇后伊琳娜·杜卡伊娜的第三子。1130年，伊萨克与他的儿子在卷入反对约翰皇帝的阴谋后逃出帝国。在1143年约翰死后的继位斗争中，他支持他的较年长的侄子，与他同名的伊萨克·科穆宁。 1150年，疾病发作使伊萨克变得虚弱，曼努埃尔一世逼迫他退出公共生活。
