多重序列比对

多重序列比对Multiple sequence alignmentMSA)是对三个以上的生物学序列(biological sequence),如蛋白质序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比对。一般来说,是输入一组假定拥有演化关系的序列。从MSA的结果可推导出序列的同源性,而种系发生关系也可引导出这些序列共同的演化始祖。如右图般的视觉化叙述可描绘出各种突变事件,例如点突变的单格变化,或是如删除突变与插入突变,可使各个序列之间产生鸿沟。MSA常用来研究序列的保守性,或是蛋白质结构域三级结构二级结构,甚至是个别的氨基酸核苷酸

计算机程序ClustalW,以多个生物个体的酸性核糖体蛋白P0(acidic ribosomal protein P0;L10E)的前90个位置所作的多重序列比对。

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外部链接

相关文献

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