甲基红色杆菌属
甲基杆菌科的一属细菌
甲基红色杆菌属(学名:Methylorubrum)是甲基杆菌科的一个属。此属的物种是革兰氏阴性(或可变)、不产生孢子、氧化酶阳性、过氧化氢酶阳性、脲酶阳性、严格需氧的杆状细菌。此属的物种细胞尺寸为0.5至1.5×1.0至10.0µm,并且大多数物种以单极、亚极或侧鞭毛来运动。该属的模式种为扭脱甲基红色杆菌(Methylorubrum extorquens)。[1][3]
甲基红色杆菌属 | |
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科学分类 | |
域: | 细菌域 Bacteria |
门: | 假单胞菌门 Pseudomonadota |
纲: | α-变形菌纲 Alphaproteobacteria |
目: | 生丝微菌目 Hyphomicrobiales |
科: | 甲基杆菌科 Methylobacteriaceae |
属: | 甲基红色杆菌属 Methylorubrum Green and Ardley 2018[1] |
模式种 | |
扭脱甲基红色杆菌 Methylorubrum extorquens (Urakami and Komagata 1984) Green and Ardley 2018
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异名[2] | |
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词源
“Methylorubrum”一词由“Methylo-”和“rubrum”组成。前缀“Methylo-”来自拉丁语“methylum”,指甲基自由基,所以“methylo-”表示与甲基自由基有关。“Rubrum”来自拉丁语“ruber”,表示红色。因此,“Methylorubrum”一词表示一种利用红色甲基自由基的微生物。[1]
历史
在甲基杆菌属被建立之后,物种的数量越来越多。彼得·格林(Peter N. Green)和朱莉·阿德利(Julie K. Ardley)两人使用16S rRNA基因测试后发现有一部分物种不该被归类为甲基杆菌属的物种。2018年,他们二人创建了甲基红色杆菌属并把甲基杆菌属的11个物种移动至该属。[3]
1984年,原单胞菌属(Protomonas)被建立。[4]隔年,该属的唯一物种被整并入甲基杆菌属(Methylobacterium)。[5]2018年,随着甲基杆菌属的重新分类,原先原单胞菌属的唯一物种也随着其他物种被纳入此属。因此原单胞菌属成了此属的异名。[3]
下属物种
本属包括以下物种:[1]
- 食胺甲基红色杆菌 Methylorubrum aminovorans (Urakami et al. 1993) Green and Ardley 2018,前称多噬耗甲基杆菌、嗜胺甲基杆菌
- 扭脱甲基红色杆菌 Methylorubrum extorquens (Urakami and Komagata 1984) Green and Ardley 2018,前称弯曲原单胞菌
- 根际甲基红色杆菌 Methylorubrum podarium (Anesti et al. 2006) Green and Ardley 2018,前称根际甲基杆菌
- 极甲基红色杆菌 Methylorubrum populi (Van Aken et al. 2004) Green and Ardley 2018,前称极甲基杆菌
- 矢竹甲基红色杆菌 Methylorubrum pseudosasae (Madhaiyan and Poonguzhali 2016) Green and Ardley 2018
- 罗兹氏甲基红色杆菌 Methylorubrum rhodesianum (Green et al. 1988) Green and Ardley 2018,前称罗氏甲基杆菌
- 浅红甲基红色杆菌 Methylorubrum rhodinum (Heumann 1962) Green and Ardley 2018,前称玫瑰色假单胞菌
- 海水甲基红色杆菌 Methylorubrum salsuginis (Wang et al. 2007) Green and Ardley 2018,前称海水甲基杆菌
- 芬兰甲基红色杆菌 Methylorubrum suomiense (Doronina et al. 2002) Green and Ardley 2018,前称芬兰甲基杆菌
- 硫氰酸盐甲基红色杆菌 Methylorubrum thiocyanatum (Wood et al. 1999) Green and Ardley 2018,前称硫氰酸盐甲基杆菌
- 扎特曼氏甲基红色杆菌 Methylorubrum zatmanii (Green et al. 1988) Green and Ardley 2018,前称扎氏甲基杆菌
参考文献
- ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 Genus: Methylorubrum. lpsn.dsmz.de. [2024-05-01]. (原始内容存档于2022-11-29) (英语).
- ^ Genus: Protomonas. lpsn.dsmz.de. [2024-05-01]. (原始内容存档于2024-05-01) (英语).
- ^ 3.0 3.1 3.2 Green, Peter N.; Ardley, Julie K. Review of the genus Methylobacterium and closely related organisms: a proposal that some Methylobacterium species be reclassified into a new genus, Methylorubrum gen. nov.. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2018, 68 (9) [2024-05-01]. ISSN 1466-5034. doi:10.1099/ijsem.0.002856. (原始内容存档于2024-07-09).
- ^ Urakami, Teizi; Komagata, Kazuo. Protomonas, a New Genus of Facultatively Methylotrophic Bacteria. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 1984, 34 (2) [2024-05-01]. ISSN 1466-5034. doi:10.1099/00207713-34-2-188. (原始内容存档于2024-07-12).
- ^ Bousfield, I. J.; Green, P. N. Reclassification of Bacteria of the Genus Protomonas Urakami and Komagata 1984 in the Genus Methylobacterium (Patt, Cole, and Hanson) Emend. Green and Bousfield 1983. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 1985, 35 (2) [2024-05-01]. ISSN 1466-5034. doi:10.1099/00207713-35-2-209. (原始内容存档于2024-07-13).
- LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature