吳福元(1962年8月—),中國岩石學家、地球化學家。主要研究中國東北、華東地區中新生代地殼增生、岩石圈演化的機制。曾發起第420項國際地質對比計劃研究東北花崗岩體的形成。開發了若干新的岩石學實驗技術。
吳福元生於安徽省廬江縣,1984年、1987年、1990年獲長春地質學院學士、碩士、博士學位。之後2年在同一學校做博士後研究。1995至1996年就讀於雷恩第一大學。2015年獲選為中國科學院院士。[1][2]