羧（ㄙㄨㄛ）肽酶（EC編號：3.4.16-3.4.18）屬於一種蛋白酶，可水解（裂解）蛋白質或肽的羧基端（C端）末的肽鍵。 過程與胺肽酶（英語：aminopeptidase）相反，該胺基肽酶在蛋白質的N末端能夠切割肽鍵。 人、動物、細菌，以及植物包含有幾種類型的羧肽酶，且具有從分解代謝至蛋白質成熟等之多種功能。[1]
產生羧肽酶的機制涉及酶受質配位水被羰基（C=O）基團受質所取代之現象。
