許祥源（1946年9月—），男，廣東普寧人，中國物理學家。長期從事原子物理和核物理的實驗和理論研究。
1970年畢業於清華大學工程物理系；1982年獲清華大學理學碩士學位；1985年至1987年在美國史丹佛大學做訪問學者。
1997年至2001年任海南大學校長。後又任清華大學研究生院副院長。2001年至2007年任首都師範大學校長。[1]
