DNA密码子表

传统上,遗传密码RNA密码子表的形式表示;这是因为在细胞核糖体制造蛋白质时,指导合成蛋白质的是信使RNA。信使RNA的序列则由基因组DNA确定。随着计算生物学基因组学的兴起,现今可在DNA水平上发现大多数基因,因此DNA密码子表变得愈加有用。[1]下表中的DNA密码子存在于有义DNA链上,并以5'端→3'端的方向排列。[2]

三个连续的DNA碱基,称为核苷酸的三联密码子。
氨基酸生化性质 极性 极性 终止密码子
标准遗传密码
碱基1 碱基2 碱基3
T C A G
T TTT (Phe/F)

苯丙氨酸

TCT (Ser/S)

丝氨酸

TAT (Tyr/Y)

酪氨酸

TGT (Cys/C)

半胱氨酸

T
TTC TCC TAC TGC C
TTA (Leu/L)

亮氨酸

TCA TAA[B] 终止赭石 TGA[B] 终止蛋白石 A
TTG TCG TAG[B] 终止琥珀 TGG (Trp/W)色氨酸 G
C CTT CCT (Pro/P)

脯氨酸

CAT (His/H)

组氨酸

CGT (Arg/R)

精氨酸

T
CTC CCC CAC CGC C
CTA CCA CAA (Gln/Q)

谷氨酰胺

CGA A
CTG CCG CAG CGG G
A ATT (Ile/I)

异亮氨酸

ACT (Thr/T)

苏氨酸

AAT (Asn/N)

天冬酰胺

AGT (Ser/S)

丝氨酸

T
ATC ACC AAC AGC C
ATA ACA AAA (Lys/K)

赖氨酸

AGA (Arg/R)

精氨酸

A
ATG[A] (Met/M)

甲硫氨酸

ACG AAG AGG G
G GTT (Val/V)

缬氨酸

GCT (Ala/A)

丙氨酸

GAT (Asp/D)

天冬氨酸

GGT (Gly/G)

甘氨酸

T
GTC GCC GAC GGC C
GTA GCA GAA (Glu/E)

谷氨酸

GGA A
GTG GCG GAG GGG G
A 密码子ATG同时编码甲硫氨酸并作为起始点:在信使RNA的编码区里,首个ATG的出现标志着蛋白质翻译的开始。[3]
B ^ ^ ^ 标示终止密码子为琥珀、赭石和蛋白石的历史原因可在悉尼·布伦纳(Sydney Brenner)的自传[4]和鲍勃·埃德加(Bob Edgar)的一篇历史性文章中找到。[5]
反向密码子表(使用IUPAC符号英语nucleic acid notation缩写)
氨基酸 密码子 缩写 氨基酸 密码子 缩写
Ala/A GCT、GCC、GCA、GCG GCN Leu/L TTA、TTG、CTT、CTC、CTA、CTG YTR、CTN
Arg/R CGT、CGC、CGA、CGG、AGA、AGG CGN、MGR Lys/K AAA、AAG AAR
Asn/N AAT、AAC AAY Met/M ATG
Asp/D GAT、GAC GAY Phe/F TTT、TTC TTY
Cys/C TGT、TGC TGY Pro/P CCT、CCC、CCA、CCG CCN
Gln/Q CAA、CAG CAR Ser/S TCT、TCC、TCA、TCG、AGT、AGC TCN、AGY
Glu/E GAA、GAG GAR Thr/T ACT、ACC、ACA、ACG ACN
Gly/G GGT、GGC、GGA、GGG GGN Trp/W TGG
His/H CAT、CAC CAY Tyr/Y TAT、TAC TAY
Ile/I ATT、ATC、ATA ATH Val/V GTT、GTC、GTA、GTG GTN
起始 ATG 终止 TAA、TGA、TAG TAR、TRA


参见

参考文献

  1. ^ Kimball, John. The Genetic Code. Kimball's Biology Pages. 2014-05-01 [2017-02-12]. (原始内容存档于2016-12-22). 
  2. ^ Shu, Jian-Jun. A new integrated symmetrical table for genetic codes. BioSystems. January 2017, 151: 21–26. Bibcode:2017arXiv170303787S. PMID 27887904. arXiv:1703.03787 . doi:10.1016/j.biosystems.2016.11.004. 
  3. ^ Nakamoto T. Evolution and the universality of the mechanism of initiation of protein synthesis. Gene. March 2009, 432 (1–2): 1–6. PMID 19056476. doi:10.1016/j.gene.2008.11.001. 
  4. ^ Brenner S. A Life in Science (2001) Published by Biomed Central Limited ISBN 0-9540278-0-9 see pages 101-104
  5. ^ The genome of bacteriophage T4: an archeological dig. Genetics. 2004, 168 (2): 575–82. PMC 1448817 . PMID 15514035. 

外部链接